当北伐军攻入江西的时候，孙传芳就指示福建的周荫人进扰粤边。福建战场是北伐进军东南五省的重要战场，战略地位仅次于江西。北伐前，统治福建的是闽省督理兼第二师师长周荫人。所辖的军队号称6万。内部矛盾重重，周荫人能指挥动的兵力不过3万余人。孙传芳成立五省联军后，周荫人部编为第四方面军，周任第四方面军总司令，将所部改编为四个军：张毅、李凤翔、刘俊分任一、二、三军军长，第四军军长周自兼任。周不是孙传芳的嫡系，但也属于孙的势力范围，奉命屯兵闽、粤边陲，牵制和威胁广州政府。

当时，闽、粤边界驻防的北伐军是何应钦第一军三个师：即谭曙卿第三师、冯轶裴第十师、钱大钧第二十师的一个团以及张贞的独立第四师，共计7000余人，不及闽军人数的三分之一。

双方都不敢轻举妄动，只是紧张备战，惟恐落后。蒋介石9月13日电示何应钦：“对福建方面应该声明，如闽不派兵侵粤赣则闽粤仍可和好相处，不入战争漩涡。否则，无论它入赣侵粤，战由他启，咎不在我。”9月中旬，何应钦鉴于两湖战场胜利推进，福建部队士气受到打击，而且他们多为北方人，不习惯山地战。最重要的是福建人民受苦已久，只要北伐军一动，便会立即响应。于是致电蒋介石，要求率师入闽作战，得到同意后，开始进行作战部署。首先调十四师冯轶裴进饶平，第三师谭曙卿赴蕉岭，兼顾大埔，并调其主力第一军屯驻三河坝，居梅县、大埔。为加强进攻力量，何应钦还调黄埔军校入伍生队千余人赴黄岗扼守，并联络福建民军响应北伐军，以便在北伐军进攻福建时配合作战。为防主力调拨前方后潮汕防务空虚，何应钦急电拨兵增防。于是，驻惠州的第六军第十八师胡谦部于9月6日赶到汕头接防，第五军军长李福林率部一师负责东江惠州的防务。此外，何应钦还委请潮州分校教育长王绳祖为潮州卫戍司令，率领学生400余人，维持潮州治安，汕头卫戍司令一职则命其弟何辑五充任，协同王绳祖任潮汕后防警戒，还在汕海马苏口敷设水雷，以防敌舰潜入。何应钦还让闽省党人宋渊源、林知渊等联络各路民军首领组织参谋团，委任宋为临时主任。参谋团尽心辅佐，出谋划策，使北伐军对闽军事进展神速。

此时，孙传芳连电周荫人，催促其出兵牵制赣中北伐军后路，周接令后即紧急出动。周军分为三路：东路第一师张毅部由福建漳浦、云霄、平和地区出发，企图进攻粤北饶平；中路十二师二十四旅刘俊部由福建永定，经峰市进攻广东松口；西路第三师李凤翔部由汀州、上杭向粤北蕉岭推进。三路人马，互为犄角。福建第四师孙云峰部为总预备队。周荫人还故弄玄虚，声东击西，公开的目标是饶平，而实际的攻击中心为松口。

10月5日，周荫人率卫队抵达永定，设立司令部，并下令总攻。10月6日，中路刘俊部全部抵达永定，并向峰市前进。何应钦判断敌人必向松口进攻，乃决定避实就虚，诱敌深入，放任刘俊前进，先攻击兵力薄弱的周荫人司令部和兵站所在地永定。

永定为闽、粤交通要道，是闽军补给中心和前线指挥首脑机关所在地。10月8日，何应钦令谭曙卿师由大埔进攻永定，并命冯轶裴师攻占峰市，切断闽军永定至松口的交通，使永、松之敌首尾不顾。同一天，曹万顺、杜启云在蕉岭起义，分别就任国民革命军第十七军（何应钦兼军长）第一、第二师师长，使周军的犄角断了一角。10月9日，谭师两个团进击永定，战幕由此拉开。经过激战，孙云峰部驻扎永定城外一个团被击溃，退入城里。10日，国民革命军对永定发起攻击。正在激战之时，周军一个团从峰市来援，革命军遭到内外夹击。何应钦见情势危急，立即率总预备队参战，当地人民由于痛恨周荫人，自动割断电线，破坏交通。周荫人与各部失去联系，无奈之下率少数卫士仓皇逃出永定城。余部投降。永定一战，俘敌1400余人，缴获炮弹500发，步枪子弹900万发，周荫人司令部人员几乎无一漏网。同时，峰市的孙云峰余部也被第十四师消灭。

北伐军占领永定后，回师进攻松口之敌。松口守敌为刘俊第三军7000余人，是闽军侵粤的主力。10月11日，冯轶裴师占领峰市后，与第三师分左右两个纵队向松口攻击前进。12日，迭克观音凹、大金坑等高地。13日凌晨，合力猛攻松口，敌军顽强抵抗，战斗十分激烈。至下午2时，闽敌刘俊放弃抵抗，向隆文、松源突围逃跑，遭到国民革命军第十七军的截击。除刘俊率200余人突围逃跑外，其余全部被歼。刘俊残部流窜闽西，沿途遭到民军袭击，途经连城附近，被民军乱枪击毙，至此闽军第三军全部覆灭。松口战役，俘敌旅长李宝珩及营团以上官佐60人，连以下官兵5900余人，缴枪5700余支。松口攻克后，10月15日，国民革命军总司令部将入闽作战的北伐军合编为东路军，任命何应钦为东路军总指挥。

永定、松口被革命军攻克后，从永定败退之敌孙云峰第四军与驻守上杭闽军李凤翔第二军，慌忙撤退到汀州（长汀），妄图凭险固守，牵制北伐东路军，并策应江西战场孙联军作战。此时，北伐军曹万顺第十七军向汀州进击。赖世璜第十四军亦奉命从江西入闽加入东路军作战。10月27日，该部东出瑞金，29日占领长汀城西北高地。北伐军第十四、十七两军，分别从东南、西北两面夹击李凤翔、孙云峰残部，随即占领长汀城。李、孙率少数随从逃走。

当松口激战正酣之时，周荫人的东路军张毅部在饶平方向被国民革命军独立第四师张贞部阻击。他得知曹、杜起义，永定失守后立即向漳州撤退。孙传芳给张毅来电，要他退往浙江，于是在10月24日，张毅又退出漳州，逃向同安。北伐军第十七军第二师、第一军第十四师跟踪追击，连克南靖、漳州。11月8日，何应钦率第三师到达漳州。张毅在同安派人与北伐军联系，就投诚的条件讨价还价，且谈且走，争取时间。北伐军与张毅且谈且追，目的是拖住敌人，等待第十四军及第二军第六师入闽截断敌人退路。张毅由同安退至泉州，11月21日，北伐军攻克泉州；张毅再向福州溃逃，沿途遭民军不断袭击，惊慌失措，士无斗志。

驻福州的闽军是福州城防司令李生春部和海军第一舰队，兵力雄厚。北伐军兵临福州城时，中共福州地委书记方尔灏，国民党左派代表施秉政以及何应钦的代表福建云霄，先后同李生春谈判，争取其“易帜反正”。中共中央特派员王荷波、国民党人林森、中共福州地委负责人，还做海军司令杨树庄、海军第一舰队司令陈秀良的工作，充分肯定他们同情北伐的进步倾向，希望同他们携手合作，经过多番谈判争取，李生春、陈秀良等联合一致，拒绝张毅入驻省城。12月2日，李、陈发表联合宣言福建云霄，表示服从国民政府，加入北伐阵线。国民党福建省临时省党部推李生春任保安司令，维持省城秩序。李生春、陈秀良等附义北伐，为国民革命军占领福州，消灭张毅顽军创造了条件。

12月9日，北伐军进占福州。18日，何应钦进入福州，将各路民军改编为新编第一军，以谭曙卿为军长。

驻上杭的周军李凤翔见手下两旅长曹万顺、杜启云已经起义，刘俊败亡，而自己仅剩骑兵两营，炮兵一团，只好退往汀州，与孙云峰合兵。12月29日，北伐军第十七军第一师与第十四军第二师会攻汀州，李、孙两部弃城而逃。

北伐军在福建作战的胜利，消灭了孙联军的第四方面军，粉碎了孙传芳利用福建进攻广东革命根据地的阴谋，打通了北伐军由闽入浙的通道，有效地配合了北伐军在江西战场同孙传芳决战，为进军苏、浙、皖准备了条件。

北伐军在福建战场迅速取得胜利的原因：首先是闽军内部矛盾重重，没有形成统一的指挥和领导核心。闽战初期，孙传芳命周荫人掌握福建军政大权，将福建境内各军统编为第四方面军，但闽军各部仍各占一方，没有真正统一过。就是北伐初期周荫人统治最得势的时候，他能指挥得动的军队不过一半。张毅自成系统，与周荫人分庭抗礼，周派旅长孔昭同，跟踪监视张毅的行动。第二军李凤翔同周有矛盾，周派亲信刘俊第三军尾随李凤翔部，随时准备缴第三军的械。此外，闽系陆军和海军的矛盾也很深。由于闽军内部矛盾重重，各军之间互不协调，貌合神离，按剑相防。因此，在战争中势必导致兵力分散，指挥不一，作战不配合。福建战场，闽军人数虽几倍于北伐军，但北伐军能有效地利用闽军的矛盾和弱点，各个击破，战而胜之。

其次，国共合作积极开展对闽军的争取和瓦解。东征福建，国共两党在北伐军中，在福建民众和闽军中做了大量的政治工作和组织工作。闽战前夕，周恩来派共产党员李木赓，北伐军总司令部派孙祥夫等赴上杭，争取闽军第二军曹、杜两部起义。共产党人王荷波、郭滴人、朱积垒、徐琛、陈明，国民党左派陈卓凡、张旭高等，以东路军政工人员，国民政府地方干部，工农运动特派员等身份，在军队中进行政治教育，治理整顿地方政权，建立和健全工农团体，组织民众积极支援北伐战争。中共福州地委书记方尔灏、蔡姗，共产党员陈烈、国民党人钮永键、林森、国民党左派施秉政等，亲自到闽军中做统战和策反工作。策动福建海军起义，争取福州城防司令反正，分化瓦解敌军，对加快福建作战的胜利进程起了重要作用。

再次，人民群众的支援和福建民军的配合。广大工农群众支前参战，福建战场也不例外。北伐军入闽后，福建人民都以各种形式踊跃支援前线。革命军打永定城时，群众自动组织起来，割断电线，破坏交通，使周荫人与各部队失去联络。北伐军所到之处，福建的工人、农民纷纷组织运输队和交通队，为军队挑行李、运粮食、送弹药、侦察敌情、联络交通。人民群众踊跃支援是北伐军克敌制胜的重要原因。

周荫人督闽期间，横征暴敛，人民不堪其苦，以“抗周自卫”相号召，自发聚众反抗。各地民军，应时而起。闽省境内，南起永定、龙岩、上杭，东到蒲田、会安、晋江，西至连城、清流、汀州，闽北、闽中的延平、戈田、龙溪，纵横数十余县，“民军蠭起，多至不可胜数”，“大者拥众三四千，小者亦有三四百，对周军均取敌意”。福建战役打响后，闽西民军罗伟部，在清流、连城等地截断长汀闽军逃窜的去路。闽南的陈国辉、叶定国、陈烈臣、林志民各部，或合攻泉州，或进击长泰，或袭扰漳州。闽北的卢兴邦部，阻止延平南下增援之敌，骚扰袭击周荫人部。总之，各部民军在“肃清省内各敌”方面，“所在有功”。福建民军大都来自农民，深受军阀的剥削和压迫，有反帝反封建的要求。对北伐军在福建战场的作战，起了很重要的配合作用。闽战结束后，东路军将福建民军收编成三个师、一个独立旅和三个独立团，组成新编第一军，委谭曙卿为军长。